En 2010, un cataclysme détruit les 2/3 de l’humanité. Le Japon se rétablit en constituant une zone spéciale protégée par sa technologie, et en exclut les plus pauvres. En 2035, deux opposants tentent d’échapper aux « Phantom », organisation chargée de supprimer toute résistance au régime. Ils s’enfuient avec une mystérieuse jeune fille au centre de nombreuses machinations…